图书介绍

生物信息学理论与技术【2025|PDF|Epub|mobi|kindle电子书版本百度云盘下载】

王廷华，王廷勇，张晓主编著
出版社：北京：科学出版社
ISBN：9787030438423
出版时间：2015
标注页数：188页
文件大小：29MB
文件页数：238页
主题词：生物信息论

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图书目录

第一章生物信息数据库1

第一节核酸序列数据库1

第二节蛋白质序列数据库9

第三节基因组数据库16

第四节结构数据库18

第五节项数据库23

第二章网络构建31

第一节 Cytoscape简介31

第二节 Cytoscape的安装32

第三节创建网络35

第四节 Cytoscape插件的应用39

第五节可视化工具GeneMANIA49

第三章幼年与老年快速老化小鼠海马中差异表达基因谱分析52

第四章成年与老年快速老化小鼠海马中差异表达基因谱分析73

第五章 miRNA相关研究90

第一节 miRNA简介及miRNA检测90

第二节 miRNA靶基因预测91

第三节基于生物信息学的miRNA靶基因功能分析95

第六章大鼠脊髓蛋白组生物信息学分析98

第七章 LncRNA数据生物信息学分析111

第一节 LncRNA的定义及来源111

第二节 LncRNA相关信息查找112

第三节大鼠LncRNA全序列查找117

第八章 DNA甲基化检测121

第一节 DNA甲基化概述121

第二节 DNA甲基化的预测125

第三节 MeDIP-PCR检测eif5a基因在脊髓损伤大鼠腓肠肌的DNA甲基化改变127

第九章如何从已知靶基因预测与其相互作用的miRNAs133

第一节用TargetScan预测调控BDNF mRNA的miRNAs133

第二节用miRanda预测调控BDNF mRNA的miRNAs135

第三节用miRDB预测调控BDNF mRNA的miRNAs136

第四节用miRwalk预测调控BDNF mRNA的miRNAs138

第五节根据需要建立各网站预测结果交集139

第六节预测中需要注意的问题141

第十章染色质免疫共沉淀技术142

第一节 ChIP技术现状背景及实验原理142

第二节 ChIP实验后续技术146

第十一章生物信息学预测蛋白质相互作用159

第一节常用的蛋白质相互作用及信号传导相关数据库160

第二节常用的蛋白质相互作用可视化工具167

第三节常用的蛋白质序列数据库169

第四节蛋白质功能、结构域和蛋白质家族有关的数据库171

第十二章利用生物信息学设计PCR引物及探针175

第一节聚合酶链反应和荧光定量聚合酶链反应的原理与方法175

第二节引物探针设计的生物信息学178